微生物相基因定序服務

微生物基因定序主要分兩類:Shotgun Metagenomics Sequencing & 16S rDNA Sequencing。

【Shotgun Metagenomics Sequencing】

直接萃取含有複雜族群樣品gDNA mixture,以物理性方式將DNA片斷化並且建庫定序,其方法可組裝出微生物基因體,得知菌相複雜度和豐富度,並做到基因註釋與功能性分析。

【16S rDNA Sequencing】

取得複雜族群樣品gDNA mixture,以PCR方式進行16S 變異區域進行放大並且建庫定序,根據其序列變異和豐富度,以達到菌相分類之目的。

 

服務種類 平台選擇
Illumina PacBio
(點我看詳細應用介紹)
Shotgun Metagenomics Sequencing 定序機型 NovaSeq 6000 Sequel II
建議規格
  • 150PE
  • ≥ 10 Gb throughput
  • 10-20 Kb Library
  • 50X /Genome
16S rDNA Sequencing 定序機型 MiSeq Sequel II / Sequel
建議規格
  • 16S V3-V4 Region (約 460 bp)
  • 300PE
  • 50,000± 10% reads
  • 16S Full-length (約 1.5 kb全長)
  • 2 Kb Library
  • ≥ 10,000± 10% CCS reads

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